Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pou6f1Q07916 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou6f1Q07916 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms