Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col9a2Q07643 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col9a2Q07643 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col9a2Q07643 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms