Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah1bQ06985 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Siah1bQ06985 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah1bQ06985 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms