Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cab39Q06138 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms