Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk18Q04899 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdk18Q04899 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms