Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smpd1Q04519 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd1Q04519 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169 ms