Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RelaQ04207 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RelaQ04207 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RelaQ04207 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RelaQ04207 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RelaQ04207 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RelaQ04207 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RelaQ04207 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RelaQ04207 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RelaQ04207 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RelaQ04207 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RelaQ04207 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RelaQ04207 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms