Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nhlh1Q02576 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nhlh1Q02576 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms