Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdcd1Q02242 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdcd1Q02242 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms