Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ly9Q01965 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ly9Q01965 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly9Q01965 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms