Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cacna1cQ01815 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacna1cQ01815 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cacna1cQ01815 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms