Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SelpQ01102 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SelpQ01102 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SelpQ01102 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SelpQ01102 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SelpQ01102 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SelpQ01102 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SelpQ01102 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelpQ01102 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelpQ01102 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelpQ01102 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelpQ01102 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelpQ01102 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms