Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Grin2bQ01097 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Grin2bQ01097 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Grin2bQ01097 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Grin2bQ01097 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms