Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga4Q00651 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms