Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou1f1Q00286 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou1f1Q00286 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou1f1Q00286 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou1f1Q00286 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms