Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stx2Q00262 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx2Q00262 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms