Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms