Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb4P99026 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb4P99026 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms