Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shc1P98083 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc1P98083 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc1P98083 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc1P98083 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc1P98083 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc1P98083 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc1P98083 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc1P98083 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shc1P98083 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shc1P98083 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shc1P98083 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shc1P98083 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms