Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
AlkP97793 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AlkP97793 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AlkP97793 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
AlkP97793 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AlkP97793 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
AlkP97793 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AlkP97793 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AlkP97793 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AlkP97793 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AlkP97793 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
AlkP97793 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
AlkP97793 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AlkP97793 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
AlkP97793 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AlkP97793 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AlkP97793 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AlkP97793 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AlkP97793 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AlkP97793 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AlkP97793 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AlkP97793 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AlkP97793 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
AlkP97793 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
AlkP97793 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
AlkP97793 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
AlkP97793 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
AlkP97793 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
AlkP97793 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AlkP97793 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AlkP97793 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AlkP97793 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AlkP97793 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AlkP97793 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AlkP97793 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AlkP97793 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
AlkP97793 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
AlkP97793 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
AlkP97793 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
AlkP97793 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
AlkP97793 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
AlkP97793 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
AlkP97793 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
AlkP97793 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
AlkP97793 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
AlkP97793 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
AlkP97793 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
AlkP97793 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
AlkP97793 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
AlkP97793 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
AlkP97793 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
AlkP97793 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
AlkP97793 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AlkP97793 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
AlkP97793 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AlkP97793 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AlkP97793 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
AlkP97793 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AlkP97793 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AlkP97793 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AlkP97793 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AlkP97793 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
AlkP97793 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
AlkP97793 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
AlkP97793 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
AlkP97793 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
AlkP97793 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AlkP97793 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
AlkP97793 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
AlkP97793 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AlkP97793 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AlkP97793 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AlkP97793 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AlkP97793 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AlkP97793 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AlkP97793 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AlkP97793 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AlkP97793 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AlkP97793 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AlkP97793 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AlkP97793 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AlkP97793 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AlkP97793 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
AlkP97793 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
AlkP97793 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
AlkP97793 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AlkP97793 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AlkP97793 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AlkP97793 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AlkP97793 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AlkP97793 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AlkP97793 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AlkP97793 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AlkP97793 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
AlkP97793 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
AlkP97793 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
AlkP97793 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AlkP97793 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AlkP97793 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
AlkP97793 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms