Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig3P97386 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig3P97386 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig3P97386 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig3P97386 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig3P97386 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig3P97386 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig3P97386 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lig3P97386 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig3P97386 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms