Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b3P97370 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1b3P97370 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b3P97370 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b3P97370 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b3P97370 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b3P97370 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b3P97370 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b3P97370 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b3P97370 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b3P97370 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b3P97370 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b3P97370 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b3P97370 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1b3P97370 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms