Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx2-3P97334 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nkx2-3P97334 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx2-3P97334 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms