Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43cP86449 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
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Trim43cP86449 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Trim43cP86449 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Trim43cP86449 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Trim43cP86449 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Trim43cP86449 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Trim43cP86449 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Trim43cP86449 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Trim43cP86449 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim43cP86449 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim43cP86449 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms