Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbx1P82976 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gbx1P82976 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbx1P82976 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbx1P82976 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbx1P82976 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbx1P82976 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbx1P82976 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbx1P82976 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbx1P82976 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbx1P82976 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbx1P82976 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbx1P82976 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbx1P82976 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbx1P82976 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms