Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx2P81066 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx2P81066 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx2P81066 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx2P81066 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx2P81066 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx2P81066 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx2P81066 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx2P81066 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx2P81066 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx2P81066 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx2P81066 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Irx2P81066 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms