Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CiitaP79621 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CiitaP79621 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CiitaP79621 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiitaP79621 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiitaP79621 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CiitaP79621 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CiitaP79621 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CiitaP79621 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiitaP79621 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CiitaP79621 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CiitaP79621 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CiitaP79621 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CiitaP79621 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CiitaP79621 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CiitaP79621 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms