Protein–RNA interactions for Protein: P70424

Erbb2, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb2P70424 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Erbb2P70424 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Erbb2P70424 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Erbb2P70424 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Erbb2P70424 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Erbb2P70424 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Erbb2P70424 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Erbb2P70424 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Erbb2P70424 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Erbb2P70424 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Erbb2P70424 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Erbb2P70424 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms