Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tp53bp1P70399 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tp53bp1P70399 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tp53bp1P70399 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms