Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb13P70321 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb13P70321 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxb13P70321 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms