Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vamp7P70280 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms