Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SnrpnP63163 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms