Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx1P63013 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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