Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ElobP62869 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ElobP62869 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ElobP62869 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ElobP62869 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ElobP62869 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ElobP62869 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ElobP62869 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ElobP62869 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ElobP62869 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ElobP62869 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ElobP62869 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ElobP62869 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ElobP62869 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ElobP62869 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ElobP62869 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ElobP62869 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ElobP62869 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ElobP62869 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ElobP62869 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ElobP62869 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ElobP62869 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ElobP62869 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ElobP62869 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ElobP62869 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ElobP62869 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ElobP62869 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ElobP62869 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ElobP62869 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ElobP62869 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ElobP62869 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ElobP62869 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ElobP62869 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ElobP62869 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ElobP62869 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ElobP62869 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ElobP62869 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ElobP62869 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ElobP62869 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ElobP62869 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ElobP62869 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ElobP62869 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ElobP62869 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ElobP62869 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ElobP62869 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ElobP62869 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ElobP62869 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ElobP62869 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ElobP62869 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ElobP62869 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ElobP62869 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ElobP62869 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ElobP62869 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ElobP62869 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ElobP62869 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ElobP62869 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ElobP62869 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ElobP62869 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ElobP62869 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ElobP62869 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ElobP62869 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ElobP62869 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ElobP62869 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ElobP62869 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ElobP62869 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ElobP62869 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ElobP62869 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ElobP62869 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ElobP62869 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ElobP62869 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ElobP62869 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ElobP62869 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ElobP62869 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ElobP62869 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ElobP62869 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ElobP62869 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ElobP62869 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ElobP62869 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ElobP62869 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ElobP62869 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ElobP62869 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ElobP62869 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms