Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps4xP62702 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms