Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rab11aP62492 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11aP62492 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms