Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmo4P61969 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmo4P61969 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms