Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Vps33bP59016 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps33bP59016 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms