Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tm6sf1P58749 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms