Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P58686 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P58686 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P58686 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P58686 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P58686 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P58686 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P58686 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P58686 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P58686 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P58686 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P58686 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P58686 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P58686 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P58686 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P58686 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P58686 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P58686 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P58686 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P58686 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P58686 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P58686 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P58686 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P58686 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P58686 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P58686 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P58686 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P58686 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P58686 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P58686 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P58686 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P58686 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P58686 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P58686 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P58686 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P58686 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P58686 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P58686 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P58686 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P58686 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P58686 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P58686 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P58686 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P58686 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P58686 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P58686 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P58686 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P58686 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P58686 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P58686 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P58686 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P58686 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P58686 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P58686 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P58686 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P58686 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P58686 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P58686 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P58686 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P58686 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P58686 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P58686 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P58686 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
P58686 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P58686 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P58686 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
P58686 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P58686 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P58686 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P58686 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
P58686 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
P58686 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P58686 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
P58686 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P58686 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P58686 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P58686 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P58686 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P58686 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P58686 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms