Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smpdl3bP58242 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpdl3bP58242 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms