Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gsc2P56916 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsc2P56916 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms