Protein–RNA interactions for Protein: P56656

Cyp2c39, Cytochrome P450 2C39, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c39P56656 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2c39P56656 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2c39P56656 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms