Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TdgP56581 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TdgP56581 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TdgP56581 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TdgP56581 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TdgP56581 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TdgP56581 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TdgP56581 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TdgP56581 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TdgP56581 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TdgP56581 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TdgP56581 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TdgP56581 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TdgP56581 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TdgP56581 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TdgP56581 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TdgP56581 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TdgP56581 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TdgP56581 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TdgP56581 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TdgP56581 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TdgP56581 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TdgP56581 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TdgP56581 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TdgP56581 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TdgP56581 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TdgP56581 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TdgP56581 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TdgP56581 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TdgP56581 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TdgP56581 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TdgP56581 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TdgP56581 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TdgP56581 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TdgP56581 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TdgP56581 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TdgP56581 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TdgP56581 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TdgP56581 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TdgP56581 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TdgP56581 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TdgP56581 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TdgP56581 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TdgP56581 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TdgP56581 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TdgP56581 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TdgP56581 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TdgP56581 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TdgP56581 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TdgP56581 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TdgP56581 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TdgP56581 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TdgP56581 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TdgP56581 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TdgP56581 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TdgP56581 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TdgP56581 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TdgP56581 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TdgP56581 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TdgP56581 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TdgP56581 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TdgP56581 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TdgP56581 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TdgP56581 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TdgP56581 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TdgP56581 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TdgP56581 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TdgP56581 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TdgP56581 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TdgP56581 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TdgP56581 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TdgP56581 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TdgP56581 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TdgP56581 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TdgP56581 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TdgP56581 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TdgP56581 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TdgP56581 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TdgP56581 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TdgP56581 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TdgP56581 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TdgP56581 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TdgP56581 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TdgP56581 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TdgP56581 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TdgP56581 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TdgP56581 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TdgP56581 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TdgP56581 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TdgP56581 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TdgP56581 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TdgP56581 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TdgP56581 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TdgP56581 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TdgP56581 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TdgP56581 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TdgP56581 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TdgP56581 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TdgP56581 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TdgP56581 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms