Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NcanP55066 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NcanP55066 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NcanP55066 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NcanP55066 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NcanP55066 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NcanP55066 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NcanP55066 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NcanP55066 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NcanP55066 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NcanP55066 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NcanP55066 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NcanP55066 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NcanP55066 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NcanP55066 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NcanP55066 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NcanP55066 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NcanP55066 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NcanP55066 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NcanP55066 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NcanP55066 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NcanP55066 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NcanP55066 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcanP55066 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcanP55066 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcanP55066 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcanP55066 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NcanP55066 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcanP55066 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcanP55066 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcanP55066 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcanP55066 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcanP55066 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcanP55066 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcanP55066 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NcanP55066 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NcanP55066 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NcanP55066 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NcanP55066 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NcanP55066 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NcanP55066 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NcanP55066 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NcanP55066 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NcanP55066 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NcanP55066 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NcanP55066 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NcanP55066 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NcanP55066 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NcanP55066 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NcanP55066 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NcanP55066 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NcanP55066 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NcanP55066 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NcanP55066 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NcanP55066 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NcanP55066 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NcanP55066 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NcanP55066 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NcanP55066 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NcanP55066 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NcanP55066 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NcanP55066 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NcanP55066 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcanP55066 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcanP55066 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcanP55066 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcanP55066 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcanP55066 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcanP55066 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcanP55066 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcanP55066 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NcanP55066 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcanP55066 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcanP55066 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcanP55066 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NcanP55066 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcanP55066 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcanP55066 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcanP55066 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcanP55066 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcanP55066 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcanP55066 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcanP55066 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcanP55066 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcanP55066 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcanP55066 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NcanP55066 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcanP55066 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcanP55066 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcanP55066 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NcanP55066 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NcanP55066 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NcanP55066 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NcanP55066 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NcanP55066 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NcanP55066 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NcanP55066 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NcanP55066 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NcanP55066 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NcanP55066 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms