Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb4P54761 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms