Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacnb3P54285 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacnb3P54285 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms