Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PklrP53657 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PklrP53657 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PklrP53657 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PklrP53657 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PklrP53657 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PklrP53657 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PklrP53657 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PklrP53657 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PklrP53657 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PklrP53657 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PklrP53657 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PklrP53657 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PklrP53657 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PklrP53657 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PklrP53657 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PklrP53657 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PklrP53657 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PklrP53657 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PklrP53657 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PklrP53657 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PklrP53657 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PklrP53657 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PklrP53657 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PklrP53657 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PklrP53657 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PklrP53657 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PklrP53657 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PklrP53657 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PklrP53657 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PklrP53657 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PklrP53657 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PklrP53657 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PklrP53657 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PklrP53657 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PklrP53657 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PklrP53657 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PklrP53657 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PklrP53657 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PklrP53657 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PklrP53657 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PklrP53657 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PklrP53657 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PklrP53657 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PklrP53657 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PklrP53657 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PklrP53657 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PklrP53657 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PklrP53657 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PklrP53657 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PklrP53657 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PklrP53657 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PklrP53657 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PklrP53657 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PklrP53657 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PklrP53657 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PklrP53657 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PklrP53657 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PklrP53657 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PklrP53657 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PklrP53657 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PklrP53657 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PklrP53657 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PklrP53657 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PklrP53657 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PklrP53657 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PklrP53657 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PklrP53657 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PklrP53657 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PklrP53657 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PklrP53657 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PklrP53657 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PklrP53657 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PklrP53657 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PklrP53657 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PklrP53657 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PklrP53657 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PklrP53657 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PklrP53657 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PklrP53657 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PklrP53657 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PklrP53657 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PklrP53657 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PklrP53657 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PklrP53657 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PklrP53657 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PklrP53657 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PklrP53657 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PklrP53657 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PklrP53657 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PklrP53657 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PklrP53657 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PklrP53657 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PklrP53657 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PklrP53657 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PklrP53657 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PklrP53657 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PklrP53657 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PklrP53657 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PklrP53657 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms