Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna1P52793 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efna1P52793 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna1P52793 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna1P52793 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna1P52793 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna1P52793 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efna1P52793 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efna1P52793 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efna1P52793 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efna1P52793 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms