Protein–RNA interactions for Protein: P52480

Pkm, Pyruvate kinase PKM, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkmP52480 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PkmP52480 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PkmP52480 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PkmP52480 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PkmP52480 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PkmP52480 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PkmP52480 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PkmP52480 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PkmP52480 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PkmP52480 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PkmP52480 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PkmP52480 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PkmP52480 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PkmP52480 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PkmP52480 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PkmP52480 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PkmP52480 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PkmP52480 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PkmP52480 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PkmP52480 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PkmP52480 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PkmP52480 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PkmP52480 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PkmP52480 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PkmP52480 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PkmP52480 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PkmP52480 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PkmP52480 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PkmP52480 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PkmP52480 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PkmP52480 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PkmP52480 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PkmP52480 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PkmP52480 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PkmP52480 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PkmP52480 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PkmP52480 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PkmP52480 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PkmP52480 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PkmP52480 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PkmP52480 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PkmP52480 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PkmP52480 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PkmP52480 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PkmP52480 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PkmP52480 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PkmP52480 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PkmP52480 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PkmP52480 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PkmP52480 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PkmP52480 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PkmP52480 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PkmP52480 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PkmP52480 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PkmP52480 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PkmP52480 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PkmP52480 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PkmP52480 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PkmP52480 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PkmP52480 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PkmP52480 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PkmP52480 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PkmP52480 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PkmP52480 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PkmP52480 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PkmP52480 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PkmP52480 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PkmP52480 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PkmP52480 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PkmP52480 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PkmP52480 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PkmP52480 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PkmP52480 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PkmP52480 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PkmP52480 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PkmP52480 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PkmP52480 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PkmP52480 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PkmP52480 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PkmP52480 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PkmP52480 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PkmP52480 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PkmP52480 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PkmP52480 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PkmP52480 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PkmP52480 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PkmP52480 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PkmP52480 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PkmP52480 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PkmP52480 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PkmP52480 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PkmP52480 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PkmP52480 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PkmP52480 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PkmP52480 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PkmP52480 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PkmP52480 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PkmP52480 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PkmP52480 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PkmP52480 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms